学校の指定
南島原市立中学校では、住所地で通学する学校が定められています。
学校所在地図 
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学校名 | 学年 | 通学区域 |
| 南島原市立深江中学校 | 全学年 | 深江町内全域 |
| 南島原市立布津中学校 | 全学年 | 布津町内全域 |
| 南島原市立有家中学校 | 全学年 | 有家町内全域 |
| 南島原市立西有家中学校 | 全学年 | 西有家町内全域 |
| 南島原市立北有馬中学校 | 全学年 | 北有馬町内全域 |
| 南島原市立南有馬中学校 | 全学年 | 南有馬町内全域 |
| 南島原市立口之津中学校 | 全学年 | 口之津町内全域 |
| 南島原市立加津佐中学校 | 全学年 | 加津佐町内全域 |
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就学指定校の変更 特別な事情などにより指定校以外の学校へ通学を希望される場合は、次の条件をすべて満たし、かつ、次の申請事由に該当する場合に就学指定校の変更申請が認められます。 就学指定校の変更申請について |